Aknea voidaan hoitaa tarvittaessa myös lääkkeillä. Lääkehoito määrätään aina aknen vakavuusasteen perusteella.

• Paikallinen hoito: A-vitamiinijohdannaiset- ja bentsoyyliperoksidilääkkeet. Nämä lääkkeet voivat kuitenkin kuivattaa ihoa. Lisäksi paikallisena hoitona voidaan käyttää antibiootteja, kuten tetrasykliiniä (voi aiheuttaa herkkyyttä UV-säteilylle) tai erytromysiiniä. Antibiootit tehoavat patofysiologisesti tärkeisiin Propioni-bakteereihin ja patogeeneihin, jotka aiheuttavat toissijaisia infektioita. Lääkkeet voivat kuitenkin aiheuttaa vastustuskyvyn bakteereille.
• Sisäinen hoito: Vaikean aknen hoito voi edellyttää antibiootti- tai istotretinoiinihoitoa. Naisilla aknea voidaan hoitaa myös ehkäisyvalmisteilla, joissa on estrogeeniä ja anti-androgeenitehokkaita progestogeenejä.